Поздньозимовий сорт. Відібраний у США з сіянців сорту Езоп Шпіценбург. Один із найбільш популярних і широко розповсюджених в усіх зонах промислового садівництва сортів. У новосадках останніх років присутність обмежена. Державним реєстром сортів рекомендований до використання в Північно-Кавказькому регіоні.
Дерево середньоросле з широкоокруглою кроною середньої густоти, утвореної скелетними гілками, що відходять від стовбура під невиразними кутами. З віком спостерігається поникнення гілок під вагою врожаю. Плодоносить, в основному, на кільчатках, коп'ях і плодових прутиках.
Пагони зеленувато-коричневі, слабоколінчасті, тонкі або середньої товщини, сильно опушені. Листки дрібні або середнього розміру, видовжено-яйцевидні, злегка зморшкуваті, матові, з ледь піднятими, трохи хвилястими, пильчато-городчастими краями, зелені з густим опушенням, що створює сизувато-сріблястий наліт, який є характерною сортовою ознакою Джонатана.
Плід (рис.) середнього або вищесереднього розміру, слабоприплюснутий округлої або округло-конічної форми, рівний або злегка ребристий у вершини, поверхня гладка. Основне забарвлення зеленувато-жовте, покривне — інтенсивний розмитий або зі смугами темно-червоний рум'янець, що займає майже всю поверхню плоду. Підшкірні точки малопомітні, на плодах буває оржавленість у вигляді «сіточки». Плодоніжка коротка або середня, тонка. Воронка середньої ширини, глибока, з оржавленістю. Блюдце частіше глибоке, середньої ширини зі майже отвесними стінками, злегка складчасте. Чашечка закрита. Підчашова трубка зазвичай довга, середньої ширини, воронкоподібна. Насіннєві камери закриті.
М'якоть зеленувато-біла, при дозріванні — кремова, солодко-кисла, ароматна, дуже соковита, щільна, чудового десертного смаку. В умовах півдня Росії плоди накопичують 13,7% сухих речовин, 10,6-11,3% цукрів, титрованих кислот — 0,65%, аскорбінової кислоти — 6 мг/100 г, Р-активних речовин — 100 мг/100г.
Знімають плоди в середині вересня, зберігають до квітня. У процесі зберігання плоди покриваються гіркою «джонатановою» плямистістю і підв'ядають.
Сорт скороплідний — на середньорослих підщепах плодоносить з 5 років. Врожайність висока — окремі дерева в радгоспі «Сад-Гігант» давали по 490 кг з дерева. При вирощуванні на недостатньо родючих ґрунтах і при дефіциті вологи зменшується продуктивність, плоди дрібнішають.
Сорт недостатньо зимостійкий — підмерзає багаторічна деревина.
Дерева відносно стійкі до парші, сильно пошкоджуються борошнистою росою.
Переваги сорту: скороплідність і висока врожайність, чудовий смак плодів.
Недоліки сорту: сильна сприйнятливість до борошнистої роси, захворювання плодів плямистістю при зберіганні, невисока зимостійкість.
Джонатан широко використовувався як вихідна форма вітчизняними та закордонними селекціонерами. З його участю створено близько 40 нових сортів (з них понад половину за кордоном), зокрема Пам'ять Сергєєву (Анис кубанський х Джонатан) селекції СКЗНІІСіВ та Айдоред (Джонатан х Вагнер) селекції США. З участю Джонатана створені такі імунні до парші сорти, як Макфрі (у походженні брали участь M. floribunda 821, Джонатан, Мекинтош, Ром Б'юті) селекції Оттавської дослідної станції (Канада) та Прайм (у походженні брали участь M. floribunda 821, Джонатан, Голден Делішес) селекції Анжерської дослідної станції (Франція).
